«Сэйсохэн» в вольном переводе означает «прошедшие годы». И в самом деле, много воды утекло с тех пор, как Химура Кэншин отказался от своего меча-сакабы в пользу спокойной жизни. Кэншин (Kenshin) и Каору (Kaoru) женились, и у них родился сын Кэнджи (Kenji). Но мир недолог, Кэншин вновь призван защищать интересы страны. Каору каждый день ходит к гавани, встречая все приходящие корабли, храня надежду, что на одном из них вернётся Кэншин. Спустя некоторое время, она начинает оглядываться на свою жизнь, прожитую с Кэншином, и вновь вспоминать былое.

Кэншин буквально умирает на фронте, его поразила неизвестная болезнь, и с каждым днём ему всё хуже. Каору, желая разделить судьбу с супругом, просит заразить и её неведомой болезнью. 

Из-за длительного отсутствия Кэншина, Кэнджи пускается на поиски Хико (Hiko), что бы обучаться искусство меча и превзойти своего отца, став лучшим мечником, чем тот когда-либо был.