Какой бы великой не была цивилизация придёт время, и ей наступит конец. Это слова наших далёких предков. Через полвека Токио, крупнейший мегаполис Азии, испытал это на себе. В 1999 году произошло крупное землетрясение, разорившее весь район Канто. Многие считают, что это было знамение свыше. Уцелевшие в руинах, смирившись с горем, начали отстраивать город заново. В итоге, из пепла возник созданный людьми остров, величиной 22 000 гектар. Город назвали "Трон". Его жители со временем вернулись к мирному существованию. Но они не знали всей правды о предназначении гигантского образовательного комплекса, появившегося в центре нового города.