Человеческой расой было создано 12 космических поселений, которые мирно существовали долгие-долгие годы. Но у людей появился враг – цивилизация роботизированных сайлонов, которая грозила уничтожением всем колониям. С большим трудом колониальным лидерам удалось договориться о мирном соглашении с киборгами, но сделка оказалась всего лишь уловкой врага. Сайлоны нанесли разрушительный удар, уничтожив большинство человеческих планет и практически всю армию.
Немногие выжившие отправились на поиски некогда затерянной 13-ой колонии под названием Земля. На пути скитальцы встречают представителей других инопланетных народов, легендарного человеческого война Каина, а также обнаруживают планету Кобол – прародительницу всего людского рода.